La série animée Pokémon a été créée au Japon suite à la popularité du premier jeu vidéo, et fut diffusée pour la première fois sur TV Tokyo le 1er avril 1997. La série fut introduite à l'étranger à partir de 1998, et fut en grande partie responsable du programme télévisé Kids' WB, sur The CW Television Network. La série continue le concept des jeux vidéo, suivant les aventures de Sacha Ketchum et son ambition de devenir un jour Maître Pokémon66. La série est maintenant diffusée sur Cartoon Network, et en est actuellement à sa onzième saison. Ces onze saisons peuvent être séparées en quatre cycles : Voyage à Kanto (saisons 1 et 2), Voyage à Johto (saisons 3 à 5), Advanced Generation (saisons 6 à 9), puis Diamant et Perle (saisons 10 et 11).
Une série diffusée en parallèle à la série principale, Pokémon Chronicles, est diffusée en tant que spin-off depuis 2002. Connue sous le nom de Ho-So Pokémon au Japon, la série consiste en 22 épisodes mettant en scène les personnages secondaires de la série principale. En France, ces épisodes furent diffusés pour la première fois en septembre 2007 sur la chaîne Gulli.

Une dizaine de longs métrages sont également sortis, dont certains uniquement au Japon. Voici la liste des films avec leur année de sortie originale :
1998 : Mewtwo contre-attaque (Pokémon The First Movie: Mew Versus Mewtwo)
1999 : Le Pouvoir est en toi (The Power of One)
2000 : Le Sort des Zarbi (Pokémon 3 The Movie)
2001 : Le Retour de Mewtwo (Mewtwo Returns) - hors-série
2001 : La Voix de la forêt (Pokémon 4ever)
2002 : Les Héros Pokémon (Pokémon Heroes)
2003 : Le Génie des voeux (Pokémon Jirachi wish Maker)
2004 : La Destinée de Déoxys (Pokémon Destiny Deoxys)
2005 : Lucario et le mystère de Mew (Lucario and the Mystery of Mew)
2006 : Pokémon Ranger et le temple de la mer (Pokémon Ranger and Temple of the Sea)
2007 : L'ascension de Darkrai (The Rise of Darkrai)
Un téléfilm d'animation. Le Maître des mirages, est également sorti en 2006.